最近有很多小伙伴咨询关于taxa的问题，小编结合多年的经验整理出来一些tasaki对应的资料，分享给大家。
生物分类法
生物分类法（英语：Taxonomy），又称科学分类法，是用生物分类学方法来对生物的物种分组和归类的办法。以级别为基础的系统层次结构中使用的一个固定数量的层次，域、界、门、纲、目、科、属和种。无级别系统使用任意数量的层次。分类的群体被称为分类单元。现代生物分类法源于林奈的系统，他根据物种共有的生理特征分类。在林奈之后，根据达尔文关于共同祖先的原则，此系统被逐渐改进。近年来，分子系统学（英语：Molecular phylogenetics）应用了生物信息学方法分析基因组DNA，正在大幅改动很多原有的分类。生物分类法属于系统分类学。
尽管林奈当时对生物分类只是为了方便鉴别，但当今人们已经广泛赞同分类应反映出达尔文关于共同祖先的原则。
随着1960年代支序分类（cladistics）或称分支学说（cladism）的出现，一个分类单元被定位在演化树的某个位置。如果一个分类单元包括且仅包括某一个共同祖先的所有后代，称其为单系群（monophyly）；相对应的，若该单元包括其共同祖先，但未包括其所有后代，则称之为并系群（paraphyly）；若该分类不包括其最相近的共同祖先，则称之为复系群（polyphyly）。根据分支学说，一个自然分类应该是单系群而非并系或复系。
有人正在计划一种新的命名法，称做PhyloCode，用来处理演化支（clade）而非分类单元（拉丁文taxon，复数taxa），但仍不清楚，这种新的命名法能否和其它的命名法则并存。
比较新的分类法中，域或称总界是最高的单元。三域系统最初被创立于1990年，此后逐渐被学界承认。大多数学者已经接受了此系统，但仍有一些学者遵循五界系统。三域系统的基本特征是将原本在细菌界（或称原核生物界(Monera））中的古细菌和真细菌独立成细菌域(Bacteria）和古菌域(Archaea）。还有一些学者将古细菌列为第六个界但不接受三域系统。
taxa
英 [‘t?ks?] 美 [‘t?ks?]
n.
分类(taxon的复数);分类( taxon的名词复数 )
分类，是指按照种类、等级或性质分别归类。下面就由我为大家带来关于分类的 英语 短语 集锦，希望大家能有所收获。
关于分类的相关短语
分类比较器 sorter comparator;
分类表 classification chart;
分类参数 sorting parameter;
分类操作 sort operation;
分类程序 sorter; sort program;
分类程序模块 sort module;
分类存储器 sorting memory;
分类单位 taxonomical unit; taxon; taxa;
分类单元 taxon (pl. taxa);
分类电话簿 classified telephone directory; yellow pages;
分类电路 sorting circuit;
分类定货 group order;
分类法 classification;
分类 方法 sorting technique;
分类符 classifier; specificator;
分类符号 class symbol;
分类 广告 classified advertisement; classifieds;
分类工 作文 件 sort work file;
分类功能 模块 sort module;
分类关键 {自} sort key;
分类规 classification gauge;
分类归并 sort merge;
分类过程 assorting process;
分类号码 class number;
分类合并 sorting and merging;
分类机 sequencer; sorter;
分类记录 book of final entry;
分类架 box; slot;
分类键 sort key;
分类交配 assortative mating;
分类阶段 {计} sorting phase;
分类阶元 taxonomic category;
分类进食 dissociate diet;
分类空间 classifying space; categorical space;
分类控制键 sort control key;
分类控制设备 segregating control equipment;
分类类目 series;
分类力学 sort mechanics;
分类量 sort capacity;
分类命题 categorical proposition;
分类模块 sort module;
分类目录 split catalogue; classified catalogue;
分类排列法 classified shelt arrangement;
分类平衡法 sort balance;
分类平衡器 {讯} ledger balance;
分类器 grader; sorter;
分类群 taxon;
分类 日记 簿 journal day book;
分类筛 classifying screen;
分类声纳 classification sonar;
分类生产法 multiline production;
分类生成程序 sort generator;
分类试验 class test;
分类树形结构 sort tree structure;
分类数据 categorical data;
分类说明 classification declaration;
分类算法 sorting algorithm;
分类随机抽样 random sampling by classification;
分类索引 classified index [subject index];
分类台 assorting table;
分类条件 class condition;
分类文件 sort file;
分类文件描述项 sort file description entry;
分类系列 {生} taxonomic series;
分类系统 categorizing [taxonomic] system;
分类细账 breakdown;
分类向量 class vector;
分类效率最佳化 optimizing sort performance;
分类信息 category message;
分类信息组 split field;
分类性状 taxonomic character;
分类应用 sort application;
分类语句 sort statement; specification statement;
分类语言学 taxonomic linguistics;
分类阅读机 sorter reader;
分类轧钢机 section steel rolling mill;
分类账 ledger; financial record; journal;
分类账簿 ledger;
分类折旧法 group depreciation method; (典型示范)
分类指导 demonstration by example or guidance to different types of areas;
分类主义 taxonomism;
分类专业小组 cut house(石油工厂的);
分类装置 sorter;
分类状况 assortment;
分类资料 grouped data;
分类子句 {计} class clause;
分类总数 batch total;
分类组合 sort merge
关于分类的相关短句
(使分别归类) classify; itemize; sort:
classify accidents by cause;
根据起因将事故分类
classify by sex [age; nationality; locality];
根据性别[年龄; 民族; 地区]分类
Men in the post office classify mail according to places it is to go.
邮局里的人员将信件按寄送地点分类。
They are classified in sorts.
它们是按品种分类的。
(分门别类) classification; assortment; systematization; partition; sorting; taxonomy; breakdown:
a broad classification;
粗略的分类
systematize classification;
使分类系统化
classification of plants
植物的分类
关于分类的相关例句
1. I furnished my first apartment with items from the want ads.
我从分类广告上购置物品，布置了我的第一间公寓。
2. The information was not easily classifiable.
此信息不易分类。
3. The books in the library are classified according to subject.
图书馆的书按学科分类。
4. The ledgers and account books had all been destroyed.
分类账本和账簿都被销毁了.
5. He posted up the export sales.
他把外销账过到分类账上.
6. Scientists divide animals, plants and rocks into classes.
科学家把动物 、 植物和矿物分类.
7. Class the books in this category.
按目录把书分类.
8. He grouped students according to ability.
他按能力把学生们分类.
9. Range the books by size.
把这些书按大小分类排列.
10. The salesman sorted his new consignment of stockings.
推销员把新到的一批长袜清理分类.
11. A greater refinement of the categorization is possible.
进行更加精细的分类是可能的.
12. He glanced his eyes down the classified advertisements.
他浏览了一下分类广告.
13. Librarians spend a lot of time classifying books.
图书馆工作人员花许多时间将书分类.
14. They are classified in sorts.
它们是按品种分类的.
15. Your best hope of obtaining a copy is to place an advert in the classifieds.
要想搞到这本书，你最好在分类广告栏刊登个广告。
以下内容都是基于Christopher P. Randle教授在研究组上交流时的课件整理而来。?
最大似然法选择的最优树是使得观察到的性状分布（character state distribution）出现的概率最大的树。
最重要的是理解似然值（likelihood）。
尝试翻译一下，就是给出一个假设 h ，该假设的似然值 L(h) 就是：在此假设是真实条件下，发生事件 d 的概率 p(d/h)。
举个简单的例子：
分子实验室里有两个好朋友Ron和Anthony要抛硬币决定谁去干活。Anthony从口袋里掏出一枚硬币，但是Ron一直怀疑Anthony的人品，因为Anthony经常放一枚假硬币（假硬币正面朝上的概率为90%，真硬币为50%）在口袋里。为了判断这枚硬币到底是真硬币还是假硬币，两个人没有去找如来佛祖，而是开始炫统计学。
此时有两个相互对立的假设（competing hypotheses）:
假设1：硬币是真的
假设2：硬币是假的
而最大似然值方法就是用来帮助评估这两个两个相互对立的假设谁更可能是真的。
在计算这两个相互对立的假设的似然值之前，我们先来说下二项分布(binomial distribution)。
在生活中，我们经常会碰到两个对立的事件，比如现在的硬币是真是假。二者非此即彼，概率相加为1。
现在还是以抛硬币为例，结果只有两种：正面朝上和反面朝上。抛硬币是个独立（每次抛硬币事件之间不会相互影响）可重复事件。假设正面朝上的概率为 p ，抛 n 次硬币，正面朝上出现 x 次的概率为：
?
然后两人开始抛硬币，抛了4次，有3次是正面朝上。
在假设1硬币是真的条件下， p=50% ，此时计算
?
假设2硬币是假的条件下， p=90% ，此时
?
0.25和0.29好像相差不大啊，于是两人继续抛了4次，都是正面朝上，现在 n=8 ， x=7 ，同上面的计算方式得到： L(h1)=0.03125,L(h2)=0.38264
假设2硬币是假的似然值就比假设1大多了。直觉告诉我们这枚硬币应该是假的。
简单翻译一下，就是根据现有的性状数据，存在千千万的系统发育树假设。对给定的系统发育树，计算在它是真实的这一假设下，使得现有性状分布出现的概率，就是该树的似然值。似然值最大的那棵系统发育树（已给定拓扑结构和分支长度信息）就是最大似然树，我们更倾向于选择它。用公式表示如下：
那么如何估算系统发育树的似然值呢(estimating the likelihood of a topology)?
再来举一个简单的例子：
有4个taxa：1、2、3、4，它们的一段DNA序列信息可以看作一套性状J(a set of character J)，由在每个位点上的碱基（性状1、2、3··j··n）组成。
对某一个位点j，我们假设它演化的拓扑结构topology1如上图右边所展示。
最大似然法和最大简约法的不同就在于它考虑了所有的情况。在最大简约法里，给出右面的topology，我们的直觉就是taxon1和taxon2上面的node应该是碱基C，这是最简单的一种解释，而最大似然法会把所有的情况考虑进去 。两个未知的形状状态（character state)，即node上的碱基，都有四种可能，即A、C、T、G四种碱基，所以可能情况的总和是4的二次方，共16种可能性，对这16种可能性我们都要进行估计。
对j性状来说，给定的topology1这一拓扑结构的似然值就是两个节点上16种碱基分布概率的加和。
值得注意的是，topology1是只是所有可能的topologies的一种假设。 除了topology1，还有其他可能的topologies，比如taxon1和taxon2是独立演化出C。?
如果系统发育树把J这套性状中的所有性状都考虑进去了（也就是这一段DNA序列所有碱基位点），那么该树的似然值就是所有性状估算的似然值的的乘积。?
?每个树的似然值都很小，因此我们一般用自然对数（ln值）表示
通过上一节我们知道，随着分类群的增加，可能的拓扑结构数量会呈指数式增长，这就造成了计算上的困难。
幸运的是，Felsenstein（1981）想出了pruning这个方法。这个方法的具体的原理不清楚。放一段英文原文：
尝试翻译一下：这个方法单个计算每个节点的似然值，从末端节点开始，向内进行，而不是估算整个树的似然值，这样就避免了在一个节点上的重复计算，每个节点只估算一次。
到目前为止，我们还没说到系统发育树是怎样包含观察到的性状分布概率的相关信息的，我们需要用模型来清楚地展示性状状态的发生过程。
怎么把一系列性状、系统发育树与概率联系起来呢(how the probability of a set of characters is estimated for a given phylogeny and model)？我们就需要模型（model）。
模型就是用数学公式来表示的一个假设，模型的预测就会以概率分布的形式呈现出来。模型最关键的是它的参数，参数决定了模型如何做出预测。
我们在这里举一个简单的建立模型的例子：
还是刚才的抛硬币问题，Ron掏出一枚硬币，我们给出一个假设：这是一枚真硬币，这时用参数：正面朝上的概率p(head)就可以表示这个假设。在“这是一枚真硬币”假设前提下下，参数p(head)的值是50%。
这是一个简单的假设模型，一个参数就可以搞定。但是当情况复杂时需要多个参数。
这个是在进化生物学中的一个概念。taxa是taxon的复数形式。
意思是为了适应气候变冷而出现的新物种。
楼下那个是胡说的，不要信。
词根一样，词义不一样。
表示“出租车”的单词是taxi，它和表示“税”的单词tax拼写非常接近，taxi其实是taxi meter cab（装有计价器的出租汽车）的简称。taxi meter（计价器）来自德语taxa meter，前面的taxi、taxa来自拉丁语，表示“应该缴纳的费用”。常见单词tax（税，征税）也来自这个词源。taxi还可以转作动词，表示飞机的缓慢滑行，这种说法来源于空载出租车在路上缓慢行驶以招揽顾客的做法。
以上就是小编对taxa和tasaki的总结，更多tasaki方面的知识可以关注我们，在网站首页进行搜索你想知道的！
